双峰驼和单峰驼的基因序列

浏览:    时间:2020-08-14 16:56

摘要:双峰驼是中国和蒙古寒冷沙漠地区的重要交通工具。在这篇文章中双峰驼基因组测序与分析联盟提出了一个2.01gb的野生和家养双峰驼基因组序列草案。并估计骆驼基因组为2.38gb,包含2

双峰驼是中国和蒙古寒冷沙漠地区的重要交通工具。在这篇文章中双峰驼基因组测序与分析联盟提出了一个2.01gb的野生和家养双峰驼基因组序列草案。并估计骆驼基因组为2.38gb,包含20821个蛋白质编码基因。

(驼可汗骆驼奶招商加盟) 这个联盟的系统基因组学分析显示,大约5500-6000万年前,骆驼与其他有蹄类动物有着共同的祖先。骆驼血统中快速进化的基因在代谢途径中显著丰富,这些变化可能是这些动物典型的胰岛素抵抗的基础。估计野生和家养骆驼的全基因组杂合度为1.0×10-3。然而,在家养骆驼中发现了杂合度明显较低的基因组区域,这些区域的嗅觉受体丰富。联盟的比较基因组学分析也可能揭示骆驼显著的耐盐性和不寻常的免疫系统的遗传基础。

(驼可汗骆驼奶招商加盟) 图1双峰驼与其他动物的基因组比较 (a)双峰驼和动物在脊椎动物(鸡和斑马鱼;NCBI基因组登录码GCF_000002315.3 and GCF_000002035.4)、哺乳动物(人、黑猩猩、小鼠和大鼠;NCBI基因组登录码GCF_000001405.21, GCF_000001515.5, GCF_000001635.20 and GCF_000001895.4)中共享的直系生物比例,Laurasiatheria(狗和马;NCBI基因组登录码GCF_000002285.3 and GCF_000002305.2)和Artiodactyla(牛和猪;NCBI基因组登录码GCF_000003055.4 and GCF_000003025.5)。

(驼可汗骆驼奶招商加盟) (b)每个支架上的共通区长度(Mb,百万碱基对)。覆盖率的计算方法是将共济区的长度除以支架的长度。覆盖率分别为>75%、>50%和<50%的脚手架用红点、绿点和灰点表示。

(c)九种哺乳动物的超树推理。拓扑由输入树引导百分比计算。距离以百万年为单位显示。 (d)通过KEGG路径,点代表骆驼和牛dN/dS比率的中间对。快速进化的基因在骆驼和牛中显著富集(FDRo0.05)的途径分别被染成红色和绿色。MAPK,丝裂原活化蛋白激酶;mTOR,雷帕霉素的哺乳动物靶点;TCA,三羧酸循环

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